Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD21O60216 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD21O60216 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD21O60216 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD21O60216 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD21O60216 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD21O60216 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD21O60216 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAD21O60216 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAD21O60216 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RAD21O60216 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD21O60216 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD21O60216 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD21O60216 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD21O60216 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RAD21O60216 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD21O60216 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD21O60216 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RAD21O60216 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD21O60216 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD21O60216 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD21O60216 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD21O60216 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD21O60216 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD21O60216 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD21O60216 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAD21O60216 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD21O60216 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD21O60216 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD21O60216 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD21O60216 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD21O60216 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RAD21O60216 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD21O60216 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD21O60216 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD21O60216 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD21O60216 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD21O60216 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RAD21O60216 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RAD21O60216 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD21O60216 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD21O60216 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD21O60216 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD21O60216 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD21O60216 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RAD21O60216 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD21O60216 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD21O60216 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD21O60216 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD21O60216 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD21O60216 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RAD21O60216 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD21O60216 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD21O60216 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD21O60216 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD21O60216 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD21O60216 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD21O60216 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RAD21O60216 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD21O60216 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD21O60216 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD21O60216 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD21O60216 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD21O60216 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD21O60216 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD21O60216 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD21O60216 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD21O60216 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD21O60216 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD21O60216 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD21O60216 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD21O60216 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD21O60216 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD21O60216 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD21O60216 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms