Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXC11O43248 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC11O43248 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXC11O43248 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms