Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms