Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NPIPA5E9PKD4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NPIPA5E9PKD4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms