Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CBY3A6NI87 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CBY3A6NI87 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms