Protein–RNA interactions for Protein: A2VCK2

DCDC2B, Doublecortin domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC2BA2VCK2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCDC2BA2VCK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DCDC2BA2VCK2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms