Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NDUFAF1Q9Y375 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NDUFAF1Q9Y375 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms