Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LEMD3Q9Y2U8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LEMD3Q9Y2U8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LEMD3Q9Y2U8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LEMD3Q9Y2U8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LEMD3Q9Y2U8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LEMD3Q9Y2U8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LEMD3Q9Y2U8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms