Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC27A6Q9Y2P4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A6Q9Y2P4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC27A6Q9Y2P4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms