Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRNDQ9UKY0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRNDQ9UKY0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRNDQ9UKY0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRNDQ9UKY0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRNDQ9UKY0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRNDQ9UKY0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRNDQ9UKY0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRNDQ9UKY0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRNDQ9UKY0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms