Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
KDM5BQ9UGL1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
KDM5BQ9UGL1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
KDM5BQ9UGL1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KDM5BQ9UGL1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms