Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DKK2Q9UBU2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DKK2Q9UBU2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms