Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NKIRAS2Q9NYR9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NKIRAS2Q9NYR9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms