Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NECAP2Q9NVZ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NECAP2Q9NVZ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms