Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BATF3Q9NR55 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BATF3Q9NR55 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms