Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZCCHC17Q9NP64 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZCCHC17Q9NP64 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZCCHC17Q9NP64 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZCCHC17Q9NP64 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms