Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHACTR1Q9C0D0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHACTR1Q9C0D0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHACTR1Q9C0D0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms