Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CELF4Q9BZC1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CELF4Q9BZC1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CELF4Q9BZC1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms