Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MXRA8Q9BRK3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MXRA8Q9BRK3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MXRA8Q9BRK3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MXRA8Q9BRK3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MXRA8Q9BRK3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MXRA8Q9BRK3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MXRA8Q9BRK3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MXRA8Q9BRK3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MXRA8Q9BRK3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MXRA8Q9BRK3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms