Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CITED2Q99967 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED2Q99967 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms