Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCN3Q96D15 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCN3Q96D15 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms