Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GCC1Q96CN9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GCC1Q96CN9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GCC1Q96CN9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms