Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX3LQ8TDB6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DTX3LQ8TDB6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3LQ8TDB6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms