Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ANKRD53Q8N9V6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ANKRD53Q8N9V6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms