Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPAS3Q8IXF0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPAS3Q8IXF0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS3Q8IXF0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS3Q8IXF0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS3Q8IXF0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPAS3Q8IXF0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPAS3Q8IXF0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms