Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTU1Q7Z7A3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTU1Q7Z7A3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTU1Q7Z7A3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTU1Q7Z7A3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTU1Q7Z7A3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTU1Q7Z7A3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTU1Q7Z7A3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTU1Q7Z7A3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CTU1Q7Z7A3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTU1Q7Z7A3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms