Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J8

UBE3D, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, humanhuman

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3DQ7Z6J8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE3DQ7Z6J8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UBE3DQ7Z6J8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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