Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP30Q70CQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
USP30Q70CQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP30Q70CQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms