Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SWSAP1Q6NVH7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SWSAP1Q6NVH7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SWSAP1Q6NVH7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms