Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMTC4Q5T4D3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMTC4Q5T4D3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMTC4Q5T4D3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms