Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNAP47Q5SQN1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNAP47Q5SQN1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP47Q5SQN1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms