Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9B1Q4ZJI4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9B1Q4ZJI4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC9B1Q4ZJI4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms