Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVEP1Q4LDE5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SVEP1Q4LDE5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVEP1Q4LDE5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 321 ms