Protein–RNA interactions for Protein: Q3KR37

GRAMD1B, GRAM domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1BQ3KR37 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRAMD1BQ3KR37 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRAMD1BQ3KR37 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms