Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX2Q16385 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX2Q16385 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX2Q16385 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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