Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFTN1Q14699 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN1Q14699 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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