Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CUL4AQ13619 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CUL4AQ13619 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CUL4AQ13619 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms