Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SNTB2Q13425 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNTB2Q13425 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms