Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRJQ12913 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRJQ12913 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRJQ12913 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
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