Protein–RNA interactions for Protein: Q06830

PRDX1, Peroxiredoxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX1Q06830 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDX1Q06830 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDX1Q06830 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDX1Q06830 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDX1Q06830 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDX1Q06830 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRDX1Q06830 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRDX1Q06830 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms