Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
EXOSC9Q06265 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
EXOSC9Q06265 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EXOSC9Q06265 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.6 ms