Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CLTCQ00610 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CLTCQ00610 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CLTCQ00610 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms