Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF3P78545 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF3P78545 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF3P78545 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF3P78545 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELF3P78545 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELF3P78545 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELF3P78545 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELF3P78545 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ELF3P78545 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF3P78545 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF3P78545 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF3P78545 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF3P78545 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF3P78545 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF3P78545 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF3P78545 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ELF3P78545 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ELF3P78545 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF3P78545 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF3P78545 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF3P78545 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF3P78545 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF3P78545 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF3P78545 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF3P78545 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELF3P78545 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF3P78545 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF3P78545 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF3P78545 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF3P78545 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF3P78545 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF3P78545 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF3P78545 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF3P78545 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELF3P78545 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ELF3P78545 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELF3P78545 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELF3P78545 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF3P78545 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF3P78545 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF3P78545 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF3P78545 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF3P78545 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF3P78545 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF3P78545 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms