Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPEP62304 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNRPEP62304 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 377.5 ms