Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERVS71-1P61550 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ERVS71-1P61550 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms