Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP107P57740 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP107P57740 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP107P57740 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP107P57740 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP107P57740 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP107P57740 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP107P57740 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP107P57740 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP107P57740 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP107P57740 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP107P57740 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP107P57740 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP107P57740 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP107P57740 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP107P57740 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP107P57740 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP107P57740 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP107P57740 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP107P57740 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP107P57740 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP107P57740 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP107P57740 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP107P57740 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP107P57740 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP107P57740 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP107P57740 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP107P57740 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP107P57740 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP107P57740 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP107P57740 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUP107P57740 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP107P57740 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP107P57740 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP107P57740 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP107P57740 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP107P57740 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP107P57740 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP107P57740 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP107P57740 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP107P57740 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP107P57740 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP107P57740 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP107P57740 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP107P57740 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP107P57740 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP107P57740 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP107P57740 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP107P57740 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP107P57740 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms