Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP11P51784 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP11P51784 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP11P51784 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP11P51784 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP11P51784 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP11P51784 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP11P51784 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP11P51784 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP11P51784 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP11P51784 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP11P51784 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP11P51784 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP11P51784 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP11P51784 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP11P51784 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP11P51784 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP11P51784 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
USP11P51784 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP11P51784 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP11P51784 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP11P51784 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP11P51784 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP11P51784 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP11P51784 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP11P51784 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP11P51784 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP11P51784 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP11P51784 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP11P51784 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP11P51784 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP11P51784 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP11P51784 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
USP11P51784 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP11P51784 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP11P51784 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP11P51784 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP11P51784 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP11P51784 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP11P51784 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP11P51784 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP11P51784 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP11P51784 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP11P51784 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP11P51784 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP11P51784 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP11P51784 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP11P51784 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP11P51784 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP11P51784 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP11P51784 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP11P51784 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP11P51784 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP11P51784 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP11P51784 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP11P51784 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP11P51784 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP11P51784 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP11P51784 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP11P51784 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP11P51784 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP11P51784 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP11P51784 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP11P51784 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP11P51784 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP11P51784 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP11P51784 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP11P51784 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP11P51784 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP11P51784 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP11P51784 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP11P51784 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP11P51784 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP11P51784 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USP11P51784 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP11P51784 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP11P51784 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP11P51784 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP11P51784 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP11P51784 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP11P51784 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP11P51784 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP11P51784 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP11P51784 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP11P51784 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP11P51784 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP11P51784 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP11P51784 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP11P51784 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP11P51784 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP11P51784 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152 ms