Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSC2P49815 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC2P49815 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC2P49815 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC2P49815 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC2P49815 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC2P49815 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC2P49815 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC2P49815 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSC2P49815 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC2P49815 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC2P49815 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC2P49815 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC2P49815 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC2P49815 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC2P49815 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSC2P49815 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSC2P49815 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC2P49815 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC2P49815 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC2P49815 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC2P49815 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC2P49815 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC2P49815 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSC2P49815 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSC2P49815 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC2P49815 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC2P49815 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC2P49815 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC2P49815 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC2P49815 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC2P49815 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC2P49815 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSC2P49815 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC2P49815 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC2P49815 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC2P49815 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC2P49815 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC2P49815 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC2P49815 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSC2P49815 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSC2P49815 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSC2P49815 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSC2P49815 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSC2P49815 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC2P49815 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC2P49815 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC2P49815 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC2P49815 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC2P49815 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC2P49815 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSC2P49815 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC2P49815 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC2P49815 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC2P49815 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC2P49815 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC2P49815 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC2P49815 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC2P49815 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSC2P49815 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSC2P49815 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms