Protein–RNA interactions for Protein: P38291

POP7, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP7, yeast

Predictions only

Length 140 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP7	P38291	HMG1	YML075C	3165 nt		4.13	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	LPP1	YDR503C	825 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SUP19	tS(UGA)E	82 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SUP17	tS(UGA)I	82 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SUP16	tS(UGA)P	82 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	LYS12	YIL094C	1116 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	YGP1	YNL160W	1065 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SET6	YPL165C	1122 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	CDC28	YBR160W	897 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	RAD1	YPL022W	3303 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	MNT2	YGL257C	1677 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	TAF7	YMR227C	1773 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SMF3	YLR034C	1422 nt		4.12	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SNF2	YOR290C	5112 nt		4.11	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	RRP45	YDR280W	918 nt		4.11	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	DJP1	YIR004W	1299 nt		4.11	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	CYC1	YJR048W	330 nt		4.11	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	URE2	YNL229C	1065 nt		4.11	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	KAR2	YJL034W	2049 nt		4.11	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	CDC6	YJL194W	1542 nt		4.11	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	YER077C	YER077C	2067 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SPT23	YKL020C	3249 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SSH4	YKL124W	1740 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SMF1	YOL122C	1728 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	AAT2	YLR027C	1257 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SWC7	YLR385C	399 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	SML1	YML058W	315 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	COX15	YER141W	1461 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	LCB2	YDR062W	1686 nt		4.1	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	YML082W	YML082W	1950 nt		4.09	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	YEA6	YEL006W	1008 nt		4.09	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	RPL28	YGL103W	450 nt		4.09	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	YPL114W	YPL114W	420 nt		4.09	□□□□□ -1.75
POP7	P38291	IXR1	YKL032C	1794 nt		4.09	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	FAA1	YOR317W	2103 nt		4.09	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	tL(UAA)B1	tL(UAA)B1	84 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	tL(UAA)B2	tL(UAA)B2	84 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	tL(UAA)D	tL(UAA)D	84 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	SUP51	tL(UAA)J	84 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	tL(UAA)K	tL(UAA)K	84 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	tL(UAA)L	tL(UAA)L	84 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	tL(UAA)N	tL(UAA)N	84 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YGL188C	YGL188C	174 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	RTA1	YGR213C	954 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	ASF1	YJL115W	840 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	PAU17	YLL025W	375 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YLR156W	YLR156W	345 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YLR159W	YLR159W	345 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YLR161W	YLR161W	345 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	SRV2	YNL138W	1581 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	GPI18	YBR004C	1302 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	HFI1	YPL254W	1467 nt		4.08	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	HXT3	YDR345C	1704 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	MDM31	YHR194W	1740 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	ATG18	YFR021W	1503 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	RPT1	YKL145W	1404 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YDR034W-B	YDR034W-B	156 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	SUA5	YGL169W	1281 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	FMO1	YHR176W	1299 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	SPO7	YAL009W	780 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	DRE2	YKR071C	1047 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	UBI4	YLL039C	1146 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	REX4	YOL080C	870 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	SCP1	YOR367W	603 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	PMT4	YJR143C	2289 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	RAT1	YOR048C	3021 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	GDB1	YPR184W	4611 nt		4.07	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	UBP6	YFR010W	1500 nt		4.06	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	IMG1	YCR046C	510 nt		4.06	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	GCS1	YDL226C	1059 nt		4.06	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	PEX7	YDR142C	1128 nt		4.06	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	SCW4	YGR279C	1161 nt		4.06	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	NTR2	YKR022C	969 nt		4.06	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YLL059C	YLL059C	507 nt		4.06	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	RDH54	YBR073W	2877 nt		4.06	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	GLN4	YOR168W	2430 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	EMP46	YLR080W	1335 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	RPS11A	YDR025W	471 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YER010C	YER010C	705 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	MDH1	YKL085W	1005 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	ISA1	YLL027W	753 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YLR118C	YLR118C	684 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YBL044W	YBL044W	369 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	SPS19	YNL202W	879 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	PUS4	YNL292W	1212 nt		4.05	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YFL034W	YFL034W	3222 nt		4.04	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	VID28	YIL017C	2766 nt		4.04	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.04	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YDL218W	YDL218W	954 nt		4.04	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	BGL2	YGR282C	942 nt		4.04	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YIA6	YIL006W	1122 nt		4.04	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	YIR017W-A	YIR017W-A	600 nt		4.04	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	RPS15	YOL040C	429 nt		4.04	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	TYW1	YPL207W	2433 nt		4.04	□□□□□ -1.76
POP7	P38291	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.5 ms