Protein–RNA interactions for Protein: P23435

CBLN1, Cerebellin-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN1P23435 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBLN1P23435 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBLN1P23435 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms